抗性基因是选择基因的一种，所以属于标记基因。
通过自我复制，基因是遗传信息的载体。通过几代人的选择，可以选择抗性基因来培养新的抗性品种，从而产生具有良好商品性状的抗污染病品系。
基因工程中用于选择的抗性基因一般在载体上。以四环素加环丝氨酸平板培养基选用四环素加环丝氨酸平板培养基重组克隆为例，如在Tetr上插入外源dna导致四环素抗性基因失活，由于Tetr失活细菌的生长受到四环素的抑制，因此它们不会被丝绸氨酸杀死。Tetr不失活的细菌抗四环素为了保存它们可以分裂生长，但是会被丝氨酸杀死。因此，重组克隆可以根据四环素和丝绸氨酸培养基是否存活来筛选。不同的抗性基因有不同的筛选方法，有的需要借助显色反应，要根据具体基因来定。
抗性基因怎么产生的？
第一种观点是，细菌的变化遵循法国进化者拉马克的获得性遗传理论，也就是说，生物体的特征变化具有适应性和一定性和一定的方向，可以在个体生命过程中遗传给后代。这一理论强调，生物变异的主要原因是外部环境条件，并在促进生物进化方面发挥。第二种观点是，细菌的进化遵循达尔文的自然选择理论，通过遗传、变异和自然选择，从低到高，从简单到复杂，从少到多。到底哪一种观点是合理的呢？
1943年，获得诺贝尔奖提名的生物学家萨尔瓦多·卢瑞亚在校友舞会上设计了实验，让别人在玩老虎机的时候大吃一惊。卢瑞亚在100个含有培养液的试管中加入等量的对病毒敏感的细菌。在细菌培养了一天后，他又准备了100个培养皿，每个培养皿里除了富含细菌生长所需要的养料外，还含有能够杀死细菌的病毒。然后，他在一个培养皿中平铺了每一根试管中培养的细菌，继续培养。如果有细菌对病毒免疫，细菌会在培养皿中形成肉眼可见的斑点。卢瑞亚推断，如果后天就得到了细菌的免疫力，也就是说，他们在处理病毒的过程中，不知道如何学会如何不被病毒杀死，因为所有的细菌都面临着来自病毒的相同挑战，所以每个培养皿中的细菌斑点数量应该是相同的。
然而，如果这种免疫来自细菌本身的随机变异(这种免疫是自发产生的，与病毒的存在无关)，那么不同数量的斑点将出现在这100个培养皿中。大约每500万个细胞就会发生一次，因为突变是一种罕见的现象，大多数培养皿应该没有斑点。就像卢瑞亚预测的那样，大部分培养皿都是空的，对于有菌斑的培养皿来说，内菌斑的数量也有很大的不同。这表明，随机发生了细菌获得的免疫突变，与病毒是否存在无关。能量强调自然选择的重要性，能及生命起源和进化的物质基础以及它们演变的动力、方向和方式，能源进化理论不仅从生物在自然中的价值的角度回答了自然选择的依据。生命的起源和进化必须以某些物质为基础，不可能无中生有，抗性基因的出现自然更不可能。
