2004年:一种检测蛋白质的选择压力的新方法

2004年4月29日的《自然》杂志发表了一篇论文,描述了一种检测蛋白质的选择压力的新方法,其新颖之处在于:它可以只以一种单一基因组为研究对象,而不用(传统方法)比较核苷酸序列。

经典的对蛋白质(承受)的选择压力进行测量的方法需要比较来自为数众多的个体或物种的核苷酸序列,并有赖于许多的同源序列。这种方法的应用会受到以下情况的限制:缺乏合适的同源物;对另外的基因组进行测序的不方便;受比较的蛋白质缺乏可识别的同源蛋白。

乔舒亚 · 普罗特金(Joshua Plotkin)是本论文的首席作者、来自于鲍尔基因组学研究中心。他介绍说:“文章描述了一种分析DNA序列的新方法,它可以识别处在(选择)压力下的一种基因组中的所有基因,不论它们是进化的还是不进化的。其优点在于:你只需面对你感兴趣的一种单一基因组并察看其序列,你就可以不用比较同源基因而发现隐藏的蛛丝马迹。”

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