随着高通量测序的发展，我们对于生物的基因组序列及其上的功能元件都有了比较深入的了解。人类的基因组一共只有23对染色体，却由总共30亿个碱基对串联而成，如此长的DNA必然要经过层层折叠才能塞到细胞核中，然而我们对于基因组的高维结构却知之甚少。基因组并不是散乱地分布在细胞核中，而是有序地层层折叠，这使得线性距离非常远的DNA片段可能在空间上相互作用。
高维基因组的研究目前最成熟的技术则是染色质构象捕获(Chromosome conformation capture, 简称3C)及其衍生技术，2009年，由3C技术的发明人Dekker教授课题组提出了3C的高通量版本Hi-C，于是才有了成熟的全基因组范围的染色质互作分析方法，同时也为染色体高维结构的分析提供了可能。
